Organ techniczny Federacji Hiszpańskiej szybko zaczął nabierać kształtu po pożegnaniu się z Fernando Hierro. Nowym dyrektorem sportowym reprezentacji został Jose Francisco Molina, z którym związano się dwuletnim kontraktem. Podczas kariery piłkarskiej 47-latek był bramkarzem i występował w Valencii, Villarrealu, Albacete, Atletico Madryt, Deportivo La Coruna i Levante, w którym w 2007 roku przeszedł na emeryturę.

Dobre stosunki z Luisem Rubialesem, prezesem RFEF pozwoliły szybko sfinalizować przejęcie przez Moliny funkcji dyrektora sportowego. 47-latek pozostawał bez zatrudnienia, dlatego jego zakontraktowanie nie przysporzyło dodatkowych problemów z ewentualnym poprzednim pracodawcą.

Jose Francisco Molina 9-krotnie wystąpił w reprezentacji Hiszpanii, debiutując 24 kwietnia 1996 roku. Swój udział dla kadry zaznaczył podczas występów na Mundialu w 1998 roku i Mistrzostwach Europy w 1996 oraz 2000 roku.

Po przejściu na emeryturę, 47-latek pracował na wszystkich szczeblach młodzieżowych w Villarrealu, a także w pierwszym zespole. Następnie prowadził Getafe B, klub z Hongkongu - Kitchee SC, indyjski ATK i meksykański San Luis.